MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium botulinum F str. Langeland chromosome

Total Repeats: 89856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009699	AATA	2	8	36	43	75 %	25 %	0 %	0 %	153940298
2	NC_009699	AAGT	2	8	65	72	50 %	25 %	25 %	0 %	153940298
3	NC_009699	AAT	2	6	115	120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940298
4	NC_009699	TTAC	2	8	205	212	25 %	50 %	0 %	25 %	153940298
5	NC_009699	A	7	7	216	222	100 %	0 %	0 %	0 %	153940298
6	NC_009699	ACT	2	6	244	249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153940298
7	NC_009699	GAA	2	6	250	255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153940298
8	NC_009699	A	6	6	254	259	100 %	0 %	0 %	0 %	153940298
9	NC_009699	A	7	7	263	269	100 %	0 %	0 %	0 %	153940298
10	NC_009699	ATA	2	6	272	277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940298
11	NC_009699	ATG	2	6	302	307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153940298
12	NC_009699	CTA	2	6	314	319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153940298
13	NC_009699	GCA	2	6	382	387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153940298
14	NC_009699	TAGCAG	2	12	392	403	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	153940298
15	NC_009699	TTTA	2	8	429	436	25 %	75 %	0 %	0 %	153940298
16	NC_009699	TA	3	6	435	440	50 %	50 %	0 %	0 %	153940298
17	NC_009699	TGG	2	6	441	446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153940298
18	NC_009699	ATGC	2	8	472	479	25 %	25 %	25 %	25 %	153940298
19	NC_009699	TA	3	6	490	495	50 %	50 %	0 %	0 %	153940298
20	NC_009699	AGT	2	6	519	524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153940298
21	NC_009699	TCT	2	6	532	537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153940298
22	NC_009699	AATT	3	12	554	565	50 %	50 %	0 %	0 %	153940298
23	NC_009699	GAT	2	6	574	579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153940298
24	NC_009699	AAAT	2	8	597	604	75 %	25 %	0 %	0 %	153940298
25	NC_009699	TGA	2	6	630	635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153940298
26	NC_009699	AGAA	2	8	657	664	75 %	0 %	25 %	0 %	153940298
27	NC_009699	AACA	2	8	709	716	75 %	0 %	0 %	25 %	153940298
28	NC_009699	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940298
29	NC_009699	AGA	2	6	762	767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153940298
30	NC_009699	A	6	6	850	855	100 %	0 %	0 %	0 %	153940298
31	NC_009699	TA	4	8	896	903	50 %	50 %	0 %	0 %	153940298
32	NC_009699	TAA	2	6	947	952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940298
33	NC_009699	TAG	2	6	956	961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153940298
34	NC_009699	TCA	2	6	967	972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153940298
35	NC_009699	TAA	2	6	978	983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940298
36	NC_009699	AAAC	2	8	1036	1043	75 %	0 %	0 %	25 %	153940298
37	NC_009699	ATT	2	6	1063	1068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153940298
38	NC_009699	AAG	2	6	1070	1075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153940298
39	NC_009699	TAT	2	6	1087	1092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153940298
40	NC_009699	AGA	2	6	1104	1109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153940298
41	NC_009699	AGA	2	6	1123	1128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153940298
42	NC_009699	GAA	2	6	1210	1215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153940298
43	NC_009699	TAC	2	6	1233	1238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153940298
44	NC_009699	TAA	2	6	1266	1271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940298
45	NC_009699	A	7	7	1275	1281	100 %	0 %	0 %	0 %	153940298
46	NC_009699	TAAA	2	8	1313	1320	75 %	25 %	0 %	0 %	153940298
47	NC_009699	AAAAAT	2	12	1331	1342	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153940298
48	NC_009699	A	7	7	1617	1623	100 %	0 %	0 %	0 %	153939951
49	NC_009699	TAT	2	6	1686	1691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153939951
50	NC_009699	TTA	2	6	1701	1706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153939951
51	NC_009699	TAA	2	6	1711	1716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939951
52	NC_009699	AGA	2	6	1786	1791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153939951
53	NC_009699	ATA	2	6	1829	1834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939951
54	NC_009699	AAAT	2	8	1860	1867	75 %	25 %	0 %	0 %	153939951
55	NC_009699	AGA	2	6	1873	1878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153939951
56	NC_009699	ATA	2	6	1892	1897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939951
57	NC_009699	AT	4	8	1922	1929	50 %	50 %	0 %	0 %	153939951
58	NC_009699	TAT	2	6	1957	1962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153939951
59	NC_009699	A	6	6	2002	2007	100 %	0 %	0 %	0 %	153939951
60	NC_009699	TAG	2	6	2103	2108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939951
61	NC_009699	AAG	2	6	2134	2139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153939951
62	NC_009699	GTT	2	6	2144	2149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153939951
63	NC_009699	GATAAT	2	12	2150	2161	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153939951
64	NC_009699	AGA	3	9	2215	2223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153939951
65	NC_009699	TTTA	2	8	2263	2270	25 %	75 %	0 %	0 %	153939951
66	NC_009699	AAT	2	6	2287	2292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939951
67	NC_009699	ATT	2	6	2299	2304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153939951
68	NC_009699	TTA	2	6	2316	2321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153939951
69	NC_009699	GAA	2	6	2342	2347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153939951
70	NC_009699	ATA	2	6	2360	2365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939951
71	NC_009699	CT	3	6	2404	2409	0 %	50 %	0 %	50 %	153939951
72	NC_009699	AAG	2	6	2418	2423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153939951
73	NC_009699	GAT	2	6	2456	2461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939951
74	NC_009699	TAA	2	6	2469	2474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939951
75	NC_009699	GAA	2	6	2504	2509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153939951
76	NC_009699	AGT	2	6	2618	2623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939951
77	NC_009699	TAT	2	6	2635	2640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153939951
78	NC_009699	A	6	6	2641	2646	100 %	0 %	0 %	0 %	153939951
79	NC_009699	AAT	2	6	2696	2701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153939951
80	NC_009699	AATT	2	8	2737	2744	50 %	50 %	0 %	0 %	153938642
81	NC_009699	ATA	2	6	2750	2755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153938642
82	NC_009699	TTCT	2	8	2764	2771	0 %	75 %	0 %	25 %	153938642
83	NC_009699	CAA	2	6	2787	2792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153938642
84	NC_009699	T	6	6	2813	2818	0 %	100 %	0 %	0 %	153938642
85	NC_009699	AAGTTA	2	12	2832	2843	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153938642
86	NC_009699	A	6	6	2856	2861	100 %	0 %	0 %	0 %	153938642
87	NC_009699	GAC	2	6	2885	2890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153938642
88	NC_009699	TAA	2	6	2902	2907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153938642
89	NC_009699	ATT	2	6	2921	2926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153938642
90	NC_009699	TA	3	6	3011	3016	50 %	50 %	0 %	0 %	153940655
91	NC_009699	A	6	6	3016	3021	100 %	0 %	0 %	0 %	153940655
92	NC_009699	TAA	2	6	3030	3035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940655
93	NC_009699	ATG	2	6	3048	3053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153940655
94	NC_009699	CAAATA	2	12	3075	3086	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	153940655
95	NC_009699	TAA	2	6	3097	3102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940655
96	NC_009699	TA	3	6	3133	3138	50 %	50 %	0 %	0 %	153940655
97	NC_009699	ATAAAG	2	12	3171	3182	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153940655
98	NC_009699	ATA	2	6	3204	3209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940655
99	NC_009699	AT	3	6	3264	3269	50 %	50 %	0 %	0 %	153940655
100	NC_009699	A	6	6	3281	3286	100 %	0 %	0 %	0 %	153940655
101	NC_009699	TAAA	2	8	3297	3304	75 %	25 %	0 %	0 %	153940655
102	NC_009699	ATAAAA	2	12	3305	3316	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153940655
103	NC_009699	A	8	8	3313	3320	100 %	0 %	0 %	0 %	153940655
104	NC_009699	TGT	2	6	3346	3351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153940655
105	NC_009699	AGA	2	6	3364	3369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153940655
106	NC_009699	AAT	2	6	3376	3381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940655
107	NC_009699	TAT	2	6	3446	3451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153940655
108	NC_009699	ATA	2	6	3468	3473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940655
109	NC_009699	GAAA	2	8	3485	3492	75 %	0 %	25 %	0 %	153940655
110	NC_009699	A	6	6	3502	3507	100 %	0 %	0 %	0 %	153940655
111	NC_009699	ATG	2	6	3543	3548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153940655
112	NC_009699	AG	3	6	3583	3588	50 %	0 %	50 %	0 %	153940655
113	NC_009699	TAAAT	2	10	3604	3613	60 %	40 %	0 %	0 %	153940655
114	NC_009699	ATT	2	6	3614	3619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153940655
115	NC_009699	AAG	2	6	3635	3640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153940655
116	NC_009699	AGA	2	6	3655	3660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153940655
117	NC_009699	ATT	2	6	3715	3720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153940655
118	NC_009699	A	7	7	3742	3748	100 %	0 %	0 %	0 %	153940655
119	NC_009699	GA	3	6	3755	3760	50 %	0 %	50 %	0 %	153940655
120	NC_009699	GAT	2	6	3788	3793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153940655
121	NC_009699	AAGT	2	8	3798	3805	50 %	25 %	25 %	0 %	153940655
122	NC_009699	ACA	2	6	3844	3849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153940655
123	NC_009699	CAT	2	6	3879	3884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153940655
124	NC_009699	ATA	2	6	3890	3895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940655
125	NC_009699	A	6	6	3895	3900	100 %	0 %	0 %	0 %	153940655
126	NC_009699	ATA	2	6	3902	3907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940655
127	NC_009699	GAT	2	6	3932	3937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153940655
128	NC_009699	TAA	2	6	4005	4010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940655
129	NC_009699	AGA	2	6	4024	4029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153940655
130	NC_009699	AAG	2	6	4049	4054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153940655
131	NC_009699	TAA	2	6	4075	4080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153940655
132	NC_009699	TTC	2	6	4127	4132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153939945
133	NC_009699	GTA	3	9	4147	4155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153939945
134	NC_009699	GGAT	2	8	4242	4249	25 %	25 %	50 %	0 %	153939945
135	NC_009699	TTG	2	6	4250	4255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153939945
136	NC_009699	AT	3	6	4318	4323	50 %	50 %	0 %	0 %	153939945
137	NC_009699	ACTA	2	8	4347	4354	50 %	25 %	0 %	25 %	153939945
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